Ribo-seq：檢測正在翻譯的mRNA信息，連接轉(zhuǎn)錄組學與蛋白質(zhì)組學的橋梁

技術原理

蛋白質(zhì)是生命活動的主要承擔者,翻譯調(diào)控又是細胞內(nèi)重要的調(diào)控方式。翻譯是核糖體讀取mRNA模板來指導蛋白質(zhì)合成的過程,是基因表達的關鍵步驟。翻譯的過程受到嚴格的調(diào)控,很多疾病與翻譯異常相關,比如神經(jīng)退行性疾病、貧血癥和發(fā)育障礙等。雖然核糖體的結(jié)構(gòu)與功能研究的比較透徹,但是對于翻譯過程的調(diào)控機理還需要深入研究。

核糖體印跡測序(Ribosome profiling, Ribo-seq)，能夠詳細檢測體內(nèi)的翻譯狀態(tài)。Ribo-seq的技術核心是識別與核糖體結(jié)合的mRNA以及正在被翻譯的約30個核苷酸。對核糖體結(jié)合的mRNA片段進行測序,能夠精確記錄核糖體在翻譯過程中的位置。將轉(zhuǎn)錄組與Ribo-seq數(shù)據(jù)聯(lián)合分析,可以計算出蛋白質(zhì)的合成速率。

技術特點

Ribo-seq能夠揭示蛋白合成的時間、地點、位置、哪些蛋白質(zhì)正在被合成以及蛋白質(zhì)合成的調(diào)控機制。Ribo-seq搭建了從轉(zhuǎn)錄組學到蛋白質(zhì)組學之間的橋梁，已經(jīng)廣泛應用在動物、植物和微生物的研究中，用于揭示生長發(fā)育、形態(tài)建成、疾病發(fā)生、逆境脅迫響應的調(diào)控機制。

應用方向

Ribo-seq應用于研究轉(zhuǎn)錄本的翻譯活性、鑒定翻譯起始位點、ORF位置和蛋白質(zhì)的翻譯調(diào)控機制。

Ribo-seq技術已經(jīng)廣泛應用在動物、植物和微生物的研究中，用于揭示生長發(fā)育、形態(tài)建成、疾病發(fā)生、逆境脅迫響應的調(diào)控機制。總之，Ribo-seq能從基因組水平檢測蛋白質(zhì)的翻譯狀況，獲得正在翻譯的mRNA序列信息并解析翻譯調(diào)控機制。

藍景科信優(yōu)勢

實驗周期快、質(zhì)量高、結(jié)果穩(wěn)定可靠。

豐富的物種經(jīng)驗。

實驗流程

分析內(nèi)容

分析流程

實驗案例

送樣要求

（1）細胞樣本：建議送樣量5×10⁶-1×10⁷個。

（2）動物組織樣本：建議送樣量≥300 mg。

（3）植物組織樣本：建議送樣量≥500 mg。

樣本分組

至少2組樣品，包括對照組和實驗組，樣本數(shù)建議：3 Vs 3。

參考文獻

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